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生物信息学与表观基因组学实验室

围绕基因组“暗物质”解码的前沿科学问题,利用生物信息学、单细胞多组学和基因编辑等交叉学科技术,揭示增强子对基因表达的调控机理,探索其在发育和疾病(血液系统恶性肿瘤)的作用机制。

相关研究包括:

  • 设计生物信息学算法,解决生物多组学数据分析的定量问题;

  • 整合挖掘公共的多组学数据,解析影响细胞命运决定的增强子调控网络;

  • 与临床医生/生物学家合作,探索肿瘤细胞异质性及潜在药物靶标。

Our objective is to unravel the dark matter of the human genome by elucidating the regulatory mechanisms of enhancers that govern gene expression. In this pursuit, we aim to delineate their functional role in both development and disease, particularly in the context of blood cancer. To achieve this, we employ cutting-edge and interdisciplinary technologies, such as bioinformatics, single-cell multi-omics, and CRISPR/Cas9 genome-editing assays.

Our current research includes:

  • develop computational methods for quantification problems for various biomedical omics data;

  • elucidate the gene regulatory networks driving cell fate commitment through integrating genomic, transcriptomic, and epigenomic data;

  • work closely with biologists and clinicians to investigate the cellular heterogeneity during cancer progression and treatment response using single-cell analysis, which helps to identify potential drug targets.



科研项目:

1. 国家自然科学基金,重大研究计划培育项目,急性髓系白血病耐药和复发的免疫微环境演变规律和机制研究,2025 - 2027,主持

2. 国家自然科学基金,面上项目,基于单细胞多组学探索增强子网络在发育和疾病中的作用和机制,2024 - 2027,主持

3. 国家自然科学基金,面上项目,哺乳动物发育过程中基因表达对增强子依赖性的系统评估,2021 - 2024,主持

4. 国家自然科学基金,面上项目,整合多组学数据解析增强子之间的层次结构,2019 - 2022,主持

5. 国家重点研发计划,项目子课题:银屑病异质性的多组学分子图谱绘制与分子分型体系构建,2023 - 2026,项目骨干

6. 福建省自然科学基金,面上项目,血液肿瘤重要增强子调控元件的系统鉴定,2020 - 2023,主持

7. 福建省卫生健康委员会,省卫生健康重大科研专项,脐血干细胞移植治疗恶性血液病关键技术的研发与应用,2021 - 2025,项目骨干

8. 厦门大学,校长基金,基于单细胞多组学探索增强子网络在发育和疾病中的作用和机制,2023-2025,主持

9. 厦门大学高层次人才科研启动费,2018-2023,主持